- 一年战争已告一段落的三年后,基于地球联邦军重建计划而被提议的“高达开发计划”开始执行,其中的两台原型机RX-78GP01与RX-78GP02A为了实施性能测试而搬运至澳大利亚托林顿基地,但是吉恩残党查知此项计划,并且袭击该基地企图夺取装载有核弹的GP02A。曾经被称呼为“所罗门的恶梦”的吉恩军王牌机
- 经过重重磨难,健四郎和尤莉亚终于迎来相聚的一刻,但是他们的时间所剩无几,在尤莉亚的请求下,健四郎开始讲述这些年来的故事:作为最强杀人拳——北斗之拳的唯一继承人,健四郎和爱人尤莉亚正准备展开新的生活。然而适值乱世,愚蠢的统治者亲手毁灭了原本的文明,活下来的人为了生存而选择暴力,杀戮成为当下的唯一准