前作の主人公・円堂守ら率いる日本代表選手「イナズマジャパン」がFFI世界大会で優勝した10年後、松風天馬はそんな円堂らイナズマイレブンに憧れ、雷門中学校に入学し、雷門サッカー部に入部。しかし、サッカーは腐敗し、あの頃の熱いサッカーはどこにもなかった。突然、渦巻く暗雲に巻き込まれていく天馬たち。それが

第三期 银河　　时空之石事件之后，在圣光之路大赛足球场即将举办全新闪电日本选拔，在获选的选手中，除了天马、剑城以及神童外，全是在其他学校首次踢球的运动选手，他们要如何整顿球队迎接世界的挑战呢？　　此队与剧场版《闪电十一人GO VS纸箱战机》的新生闪电日本队并无关系，是由黑岩监督亲自从日本挑选而组成的

　　小鸟游是家中独子，上有姐姐下有妹妹，从小生活在女人堆里，酷爱一切和可爱有关的事物。机缘巧合的来到一家叫做瓦古娜利亚的餐厅打工，开始了学校、打工、家事三点一线的忙碌生活。小鸟游渐渐发现，原来瓦古娜利亚餐厅的店员都各具特色：种岛是个外形娇小，长着一张娃娃脸的可爱女生，凭借这令自己相当头疼的卡哇伊外形

　　青山君（置鲇龙太郎 配音）是富士美高中足球部的种子选手。身为前锋的他，拥有着极强的体力和爆发力，传说中，只要有他加入的球队，总会在比赛中得到最后的胜利。可是，虽然青山君十分擅长足球这项崇尚身体碰撞，尽情挥洒汗水的运动，但他本身却是一个有着极度洁癖，异常厌恶身体接触的人，甚至在竞争激烈的赛场上，青

新世历179年，一艘来历不明的巨大物体冲入地球，坠落在南亚得里亚岛。　　人类在被这一从天而降的怪物吓得惊魂未定之时，以比安.佐尔达克博士为首，科学家们对这一天外来客进行了调查。调查结果表明，此战舰是外宇宙文明所开发出来的战舰，而且令科学家们感到惊恐的是，此战舰中的高科技表明外宇宙科技比地球目前的科技

堇川奈奈子（雪野五月 配音）是一名十三岁的天才作家，某日，她来到香港参加签售会，却意外遇到了恐怖袭击活动，在导游米歇尔（菊地祥子 配音）和玛姬（平田宏美 配音）的保护下，奈奈子幸运的捡回了一条命。　　然而，事件并没有就此结束，奈奈子一行人发现，这场看似偶然的恐怖袭击活动，竟然是针对奈奈子而来。与此同

数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，　　被分为银河帝国与自由行星同盟这两个　　拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。　　两国之间的抗争持续了150年，　　以无边无际的广袤银河为舞台，　　重复着无止境的战斗。　　银河帝国的门阀贵族社会的腐败，　　以及自由行星同盟可称为民主主义的弊端的群

　　遥远未来，世界人口数在迎来巅峰后，开始呈现下降的趋势。人类为了让物种繁荣存续，制作出管理生态系的AI，并执行「人类多样化实验」。常人、兽人、魔族等经过遗传因子改造诞生的「多样人种」，在环绕高壁的生活圈之中，打造出被称作「CLUSTA」的「多样城镇」。有着丰富人口的「CLUSTA」，在各地都有不同

楠木赖子（高桥美佳子 配音）是个14岁的初中生，在班上没什么朋友，但偶然得到班上极为耀目的美少女柚木加菜子（戸松遥 配音）的青睐，两人成为朋友，不料相约乘电车去看湖时飞来横祸，加莱子落下站台被列车轧成重伤。刑警木场修太郎（关贵昭 配音）调查此案，发现加莱子似乎有着神秘的重要身 份，同时以多摩为中心，

苍月潮（畠中祐 配音）是一位身体瘦弱的平凡国中生，一次偶然中，潮在地下室里遇见了一只被封印长达五百年之久的妖怪，并于无意之中拔出了封印它的“兽茅”，使得妖怪重返人间。潮身上所爆发出来的惊人力量令妖怪震惊，它当即表示臣服于潮，于是，潮替妖怪取名“虎”（小山力也 配音）。　　成为了兽茅的继承人，潮的肩上